PHCER允许个人通过绿色出行、节能改造等行为累积碳积分，企业可定向收购用于抵消配额缺口。每年度个人积分转让上限为2000吨CO₂，防止市场操纵风险。
完成低氮燃烧器改造的燃气锅炉，其排放因子可按0.92系数折算。企业需提供改造前后烟气在线监测数据对比，热效率提升超过15%的额外获得3%配额奖励。
企业新建/扩建项目若在报告年度投产，除当年排放量外，需在后续三年持续单独填报该排放源数据。历史排放法配额分配的项目，还需补报投产前两年的预估排放量。
民用航空企业除航班燃油消耗外，需统计摆渡车、飞机牵引车等地面设备的汽油/柴油用量。航站楼供暖锅炉燃气消耗按固定源排放计算，与航班排放数据分开填报。
纺织企业退浆、定型等工序中使用的碳酸钠等化学品，需按物料平衡法计算分解产生的CO₂。染整废水处理沼气回收项目可申请碳普惠减排量抵扣，但需提前备案监测方案。
建筑陶瓷企业使用煤矸石、废塑料等混合燃料时，须按化石碳占比拆分排放量。喷雾干燥塔燃煤排放与瓷砖烧成过程碳酸盐分解排放需分开计算，并上传元素分析报告佐证。
新指南明确排放报告需附检测报告、电费发票、煤质分析记录、产能批复文件等十二类材料。代理机构编制的报告需另附服务合同及CMA资质证明，电子档案保存期延长至10年。
数据中心备用发电机组需按月进行空载试运行检测，柴油消耗量按（试机时间×额定功率×负荷系数）计算。未启用的备用设备需提供封存照片及管理台账。
企业发现历史排放数据错误需在次年6月底前提交修正申请，超过三年的不予受理。配额已清缴的误差部分，多退少补原则仅适用于误差率超过5%的重大更正。
面向欧盟市场的企业需在碳排放报告中增加产品层面数据，按ISO14067标准计算单位产值碳强度。省级平台将开通中欧碳关税数据互认通道，降低贸易壁垒。
热力生产企业需按月报告管网输送热损耗率，超过行业均值（8%）的部分按1.2倍折算排放量。采用纳米保温材料改造管网的，损耗率核查值可下浮0.5个百分点。
大型公共建筑需分项计量照明、电梯、空调系统的电力消耗，采用智能电表实现分时数据采集。改造项目的节能量可申请PHCER，但需提供第三方节能量审核报告。
